MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p01

Total Repeats: 6368

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018516	TTA	2	6	450	455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379900
2	NC_018516	TCT	2	6	466	471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379900
3	NC_018516	ATT	2	6	543	548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379900
4	NC_018516	TCT	2	6	622	627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379900
5	NC_018516	TTC	2	6	684	689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379900
6	NC_018516	CTG	2	6	707	712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379900
7	NC_018516	CTA	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379900
8	NC_018516	GAC	2	6	773	778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379900
9	NC_018516	TAC	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379900
10	NC_018516	TCT	2	6	835	840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379900
11	NC_018516	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379900
12	NC_018516	TGTT	2	8	988	995	0 %	75 %	25 %	0 %	434379900
13	NC_018516	TAA	2	6	1004	1009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379900
14	NC_018516	TAT	2	6	1037	1042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379900
15	NC_018516	TTGT	2	8	1055	1062	0 %	75 %	25 %	0 %	434379900
16	NC_018516	ATA	2	6	1065	1070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379900
17	NC_018516	AT	3	6	1090	1095	50 %	50 %	0 %	0 %	434379900
18	NC_018516	GAT	2	6	1138	1143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379900
19	NC_018516	GAA	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379900
20	NC_018516	CTT	2	6	1193	1198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379900
21	NC_018516	ACC	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379900
22	NC_018516	TAG	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379900
23	NC_018516	TAG	2	6	1410	1415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379900
24	NC_018516	TTGGTT	2	12	1425	1436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379900
25	NC_018516	CTAC	2	8	1444	1451	25 %	25 %	0 %	50 %	434379900
26	NC_018516	TACT	2	8	1466	1473	25 %	50 %	0 %	25 %	434379900
27	NC_018516	GAA	2	6	1491	1496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379900
28	NC_018516	ATT	2	6	1497	1502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379900
29	NC_018516	TAC	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379900
30	NC_018516	TTG	2	6	1674	1679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379901
31	NC_018516	CTA	2	6	1758	1763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379901
32	NC_018516	CTTG	2	8	1784	1791	0 %	50 %	25 %	25 %	434379901
33	NC_018516	TTG	2	6	1854	1859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379901
34	NC_018516	CTA	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379901
35	NC_018516	AC	3	6	2469	2474	50 %	0 %	0 %	50 %	434379902
36	NC_018516	CTT	2	6	2617	2622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379902
37	NC_018516	TTA	2	6	2631	2636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379902
38	NC_018516	ATG	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379902
39	NC_018516	TTGT	2	8	2691	2698	0 %	75 %	25 %	0 %	434379902
40	NC_018516	TC	3	6	2732	2737	0 %	50 %	0 %	50 %	434379902
41	NC_018516	AAT	2	6	2738	2743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379902
42	NC_018516	TTTC	2	8	2787	2794	0 %	75 %	0 %	25 %	434379902
43	NC_018516	TCTACT	2	12	2840	2851	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434379902
44	NC_018516	TCT	2	6	2861	2866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379902
45	NC_018516	TTACTG	2	12	2901	2912	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434379902
46	NC_018516	TAT	2	6	2920	2925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379902
47	NC_018516	TCTA	2	8	3062	3069	25 %	50 %	0 %	25 %	434379903
48	NC_018516	TTC	2	6	3095	3100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379903
49	NC_018516	GAT	2	6	3164	3169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379903
50	NC_018516	TA	3	6	3190	3195	50 %	50 %	0 %	0 %	434379903
51	NC_018516	TTTC	2	8	3220	3227	0 %	75 %	0 %	25 %	434379903
52	NC_018516	TGT	2	6	3287	3292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379903
53	NC_018516	CTA	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379903
54	NC_018516	CTA	2	6	3349	3354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379903
55	NC_018516	CTT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379903
56	NC_018516	GATT	2	8	3451	3458	25 %	50 %	25 %	0 %	434379904
57	NC_018516	TCT	2	6	3486	3491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379904
58	NC_018516	CTTTT	2	10	3575	3584	0 %	80 %	0 %	20 %	434379904
59	NC_018516	CTA	2	6	3613	3618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379904
60	NC_018516	TAT	2	6	3658	3663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379904
61	NC_018516	CT	3	6	3788	3793	0 %	50 %	0 %	50 %	434379904
62	NC_018516	TAC	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379904
63	NC_018516	TTCT	2	8	3865	3872	0 %	75 %	0 %	25 %	434379904
64	NC_018516	ACT	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379904
65	NC_018516	TCT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379905
66	NC_018516	TTC	2	6	4084	4089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379905
67	NC_018516	ACTT	2	8	4263	4270	25 %	50 %	0 %	25 %	434379905
68	NC_018516	CAT	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379905
69	NC_018516	ATA	2	6	4390	4395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379905
70	NC_018516	TC	3	6	4435	4440	0 %	50 %	0 %	50 %	434379905
71	NC_018516	TAAA	2	8	4462	4469	75 %	25 %	0 %	0 %	434379905
72	NC_018516	TTC	2	6	4471	4476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379905
73	NC_018516	TTC	2	6	4570	4575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379906
74	NC_018516	CTT	2	6	4596	4601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379906
75	NC_018516	TAC	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379906
76	NC_018516	TGT	2	6	4765	4770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379906
77	NC_018516	TGA	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379906
78	NC_018516	CATT	2	8	4857	4864	25 %	50 %	0 %	25 %	434379906
79	NC_018516	AAC	2	6	4888	4893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379906
80	NC_018516	TAC	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379906
81	NC_018516	TTTC	2	8	5043	5050	0 %	75 %	0 %	25 %	434379907
82	NC_018516	TATT	2	8	5066	5073	25 %	75 %	0 %	0 %	434379907
83	NC_018516	TC	3	6	5252	5257	0 %	50 %	0 %	50 %	434379907
84	NC_018516	AAT	2	6	5325	5330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379907
85	NC_018516	CTA	2	6	5358	5363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379907
86	NC_018516	TAT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379907
87	NC_018516	TAC	2	6	5442	5447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379907
88	NC_018516	TAAC	2	8	5621	5628	50 %	25 %	0 %	25 %	434379908
89	NC_018516	TTTC	2	8	5685	5692	0 %	75 %	0 %	25 %	434379908
90	NC_018516	CTT	2	6	5773	5778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379908
91	NC_018516	CTT	2	6	5788	5793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379908
92	NC_018516	CTT	2	6	5811	5816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379908
93	NC_018516	ATAA	2	8	5929	5936	75 %	25 %	0 %	0 %	434379909
94	NC_018516	TTC	2	6	5970	5975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379909
95	NC_018516	TCT	2	6	5978	5983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379909
96	NC_018516	AAT	2	6	5997	6002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379909
97	NC_018516	CTT	2	6	6075	6080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379909
98	NC_018516	TAA	2	6	6097	6102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379909
99	NC_018516	TGA	2	6	6116	6121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379909
100	NC_018516	ATAC	2	8	6162	6169	50 %	25 %	0 %	25 %	434379909
101	NC_018516	TGT	2	6	6395	6400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379910
102	NC_018516	TG	3	6	6439	6444	0 %	50 %	50 %	0 %	434379910
103	NC_018516	CTAG	2	8	6472	6479	25 %	25 %	25 %	25 %	434379910
104	NC_018516	TCT	2	6	6482	6487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379910
105	NC_018516	AAG	2	6	6561	6566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379910
106	NC_018516	ATA	2	6	6615	6620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379910
107	NC_018516	GTT	2	6	6621	6626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379910
108	NC_018516	CTA	2	6	6638	6643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379910
109	NC_018516	AC	3	6	6657	6662	50 %	0 %	0 %	50 %	434379911
110	NC_018516	CTTA	2	8	6665	6672	25 %	50 %	0 %	25 %	434379911
111	NC_018516	CAAG	2	8	6741	6748	50 %	0 %	25 %	25 %	434379911
112	NC_018516	CCCTT	2	10	6790	6799	0 %	40 %	0 %	60 %	434379911
113	NC_018516	AT	3	6	6895	6900	50 %	50 %	0 %	0 %	434379911
114	NC_018516	CAT	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379912
115	NC_018516	TTGT	2	8	6970	6977	0 %	75 %	25 %	0 %	434379912
116	NC_018516	TAA	2	6	7018	7023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379912
117	NC_018516	CTT	2	6	7032	7037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379912
118	NC_018516	GAA	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379912
119	NC_018516	CAT	2	6	7089	7094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379912
120	NC_018516	TCT	2	6	7136	7141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379912
121	NC_018516	TCTACT	2	12	7145	7156	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434379912
122	NC_018516	TAC	2	6	7168	7173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379912
123	NC_018516	TCT	2	6	7226	7231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379912
124	NC_018516	GTAT	2	8	7256	7263	25 %	50 %	25 %	0 %	434379912
125	NC_018516	TCTA	2	8	7282	7289	25 %	50 %	0 %	25 %	434379912
126	NC_018516	ATTC	2	8	7354	7361	25 %	50 %	0 %	25 %	434379912
127	NC_018516	CTTT	2	8	7386	7393	0 %	75 %	0 %	25 %	434379912
128	NC_018516	TAA	2	6	7420	7425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379912
129	NC_018516	CAATG	2	10	7453	7462	40 %	20 %	20 %	20 %	434379912
130	NC_018516	CTT	2	6	7476	7481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379912
131	NC_018516	TCA	2	6	7565	7570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379912
132	NC_018516	ATG	2	6	7632	7637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379912
133	NC_018516	CTT	2	6	7656	7661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379912
134	NC_018516	CATT	2	8	7771	7778	25 %	50 %	0 %	25 %	434379913
135	NC_018516	TTC	2	6	7852	7857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379913
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139	NC_018516	TTTA	2	8	7947	7954	25 %	75 %	0 %	0 %	434379913
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